प्लांट किये गए सबूतों पर भारतीय जेसुइट की आशंकाएं प्रबल। 

राजद्रोह के आरोप में जेल में बंद एक बुजुर्ग भारतीय जेसुइट फादर ने अपने लैपटॉप हार्ड ड्राइव की एक प्रति की मांग की है, जो कि अमेरिका स्थित एक डिजिटल प्रयोगशाला ने रिपोर्ट की थी कि एक हैकर ने उसी मामले के एक अन्य आरोपी के कंप्यूटर में घटिया साक्ष्य लगाए थे।

फादर स्टेन स्वामी, महाराष्ट्र के भीमा कोरेगांव क्षेत्र में हिंसा को भड़काने के लिए प्रतिबंधित माओवादी समूह के साथ सहयोग करने के 16 आरोपियों में से एक हैं, जिसमें एक व्यक्ति की मौत हो गई और 1 जनवरी, 2018 को कई लोग घायल हो गए।

एक संघीय आतंकवाद विरोधी एजेंसी, राष्ट्रीय जांच एजेंसी (NIA) ने 8 अक्टूबर को फादर स्टेन स्वामी को गिरफ्तार किया और उन्हें महाराष्ट्र की राजधानी मुंबई की एक जेल में हिरासत में भेज दिया। उनकी जमानत की अर्जी बार-बार खारिज की गई।

फादर ए. संथानम, जो फरवरी को एफसीए न्यूज को बताते हैं, "फादर स्टेन स्वामी ने उनके लैपटॉप और हार्ड ड्राइव की क्लोन कॉपी मांगी है, जो एनआईए ने उनकी गिरफ्तारी के बाद दी, लेकिन कोई फायदा नहीं हुआ।"

फादर स्टेन स्वामी के वकील ने लैपटॉप और हार्ड ड्राइव की क्लोन कॉपी की मांग के लिए 12 फरवरी को एनआईए अदालत के समक्ष एक विस्तृत तर्क प्रस्तुत किया। अदालत ने वकील को एनआईए कार्यालय से संपर्क करने का निर्देश दिया।

अदालत ने फादर स्टेन की एक और जमानत अर्जी पर भी सुनवाई की, लेकिन एनआईए, जो मामले की जांच जारी रखती है, ने अदालत में जमानत पर फैसला लेने में मदद करने के लिए केस डायरी जमा करने के लिए 16 फरवरी तक का समय मांगा।

फादर संथानम, एक जेसुइट वकील, जो दक्षिण भारत में प्रैक्टिस कर रहे थे, ने अफसोस जताया कि एनआईए फादर स्टेन स्वामी की जमानत मांग में बाधा डाल रही है, जो अन्य उम्र से संबंधित स्वास्थ्य मुद्दों के बीच पार्किंसंस रोग से पीड़ित है।

अपनी गिरफ्तारी से पहले, फादर स्टेन स्वामी ने चिंता व्यक्त की थी कि माओवादियों के साथ उनके सहयोग और उनके खिलाफ अन्य आरोपों का सबूत देने के लिए जांचकर्ता उनके कंप्यूटर में हेरफेर कर सकते हैं, जो उन्होंने उनसे जब्त किया था।

उनके डर ने मैसाचुसेट्स स्थित डिजिटल फोरेंसिक प्रयोगशाला आर्सेनल कंसल्टिंग के रूप में जमीन हासिल की। ​​11 फरवरी को कहा गया कि एक हैकर ने मामले में आरोपियों में रोना विल्सन के कंप्यूटर में घटते सबूत प्लांट किये थे।

अमेरिकी फर्म ने रोना विल्सन के लैपटॉप की एक इलेक्ट्रॉनिक प्रति का विश्लेषण किया और निष्कर्ष निकाला कि एक हैकर ने लैपटॉप पर घुसपैठ करने और उस पर दस्तावेजों को लगाने के लिए मैलवेयर का इस्तेमाल किया था।

हैकर ने एक छिपा हुआ फ़ोल्डर बनाया और कम से कम 10 गुप्त मेल (पत्रों) को रोना विल्सन की जानकारी के बिना वितरित किया गया, जो कि फादर स्टेन स्वामी की तरह जेल में भी बंद है।

एनआईए ने रोना विल्सन को गिरफ्तार किया और उस पर आरोप लगाया कि वह माओवादी विद्रोहियों के साथ मिलीभगत करके भारतीय प्रधान मंत्री नरेंद्र मोदी की हत्या करने की साजिश रच रहा था, जो ज्यादातर भ्रष्ट दस्तावेजों पर आधारित था।

रिपोर्ट में कहा गया है कि अज्ञात हैकर ने लैपटॉप पर नियंत्रण और जासूसी करने के लिए मैलवेयर का इस्तेमाल किया। इसके बाद, रोना विल्सन को एक ईमेल प्राप्त हुआ जो एक साथी कार्यकर्ता से प्रतीत होता है कि उसने एक नागरिक स्वतंत्रता समूह से एक सहज कथन डाउनलोड करने के लिए एक लिंक पर क्लिक करने का आग्रह किया। लेकिन इस लिंक ने दुर्भावनापूर्ण सॉफ़्टवेयर को तैनात किया जिसने एक हैकर को विल्सन के कंप्यूटर का उपयोग करने की अनुमति दी।

रिपोर्ट से पता चलता है कि 13 जून, 2016 को शुरू होने वाले हमलावर ने 22 महीनों तक विल्सन के कंप्यूटर तक पहुंच बनाए रखी थी, और विल्सन की अनुमति के बिना उसकी गतिविधियों पर निगरानी का संचालन करते हुए गुप्त अक्षरों को रोपण के लिए एक दूरस्थ पहुंच सुविधा का उपयोग किया था।

फोरेंसिक लैब ने यह भी पाया कि मैलवेयर ने रोना विल्सन के कीस्ट्रोक्स, पासवर्ड और ब्राउज़िंग गतिविधि को लॉग इन किया, जिससे गिरफ्तार लोगों के खिलाफ एनआईए साक्ष्य की विश्वसनीयता पर संदेह पैदा हो गया।

अधिकार समूह का कहना है कि गिरफ्तार किए गए सभी 16 अधिकार कार्यकर्ता हैं, जिन्होंने कुछ बिंदु पर हिंदुत्ववादी भारतीय जनता पार्टी (भाजपा) द्वारा संचालित संघीय सरकार की नीतियों की आलोचना की या विरोध किया।