हैदराबाद में फादर स्टेन स्वामी की अस्थियों को सार्वजनिक श्रद्धांजलि के लिए रखा गया।

कैथोलिक एसोसिएशन ऑफ़ हैदराबाद के तत्वाधान में 18 जुलाई 2021 को हैदराबाद के सेंट मैरी बेसिलिका एवं  21 जुलाई 2021 को सेंट पैट्रिक हाई स्कूल सिकंदराबाद में फादर स्टेन स्वामी की अस्थियों को सार्वजनिक श्रद्धांजलि के लिए रखा गया। जिसमे कई विश्वासियों में भाग लेकर फादर स्टेन स्वामी को श्रद्धांजलि अर्पित की। कार्यक्रम में कोविड-19 की सावधानियों का पालन करते हुए लोगों ने भक्तिपूर्वक भाग लिया। हैदराबाद आर्चडायसिस के आर्चबिशप पुला एंथोनी ने भी फादर स्टेन स्वामी को श्रद्धांजलि अर्पित की। 
फादर स्टेन स्वामी का मुंबई के हॉली फैमिली अस्पताल में एक विचाराधीन कैदी के रूप में निधन हो गया। भारत के आतंकवाद विरोधी संगठन, राष्ट्रीय जांच एजेंसी ने उन्हें 8 अक्टूबर, 2020 को मुंबई से लगभग 1,700 किलोमीटर उत्तर पूर्व में झारखंड राज्य की राजधानी रांची के पास उनके आवास से गिरफ्तार किया था। मुंबई की एक अदालत ने कई बीमारियों से ग्रसित जेसुइट फादर को शहर के पास एक भीड़भाड़ वाले तलोजा जेल में भेज दिया था और उनकी तबीयत बिगड़ने पर उन्हें बॉम्बे हाईकोर्ट के आदेश के तहत काथलिक अस्पताल में भर्ती कराया गया था।
इस साल 5 जुलाई को फादर स्टेन स्वामी की मौत के बारे में उच्च न्यायालय को सूचित करने के बाद, वरिष्ठ वकील मिहिर देसाई, जिन्होंने उच्च न्यायालय में आदिवासी अधिकार कार्यकर्ता का प्रतिनिधित्व किया था, ने अदालत को बताया था कि उनकी मृत्यु एनआईए की ओर से लापरवाही का परिणाम थी और महाराष्ट्र जेल अधिकारी जो उसे समय पर और पर्याप्त चिकित्सा सहायता प्रदान करने में विफल रहे थे।